Meksiko mengakui Slovenia yang baru merdeka pada 22 Mei 1992. Pada tahun 1996, Meksiko membuka konsulat kehormatan di Ljubljana.[2] Pada tahun 1998, Duta Besar Slovenia, Dimitrij Rupel, menyatakan bahwa ada hubungan bilateral yang mendalam antara negaranya dan Meksiko, dan bahwa Slovenia akan mendukung Meksiko di forum internasional mana pun, karena Meksiko adalah bagian dari Perjanjian Perdagangan Bebas Amerika Utara (NAFTA), yang memberikan peluang untuk meningkatkan perdagangan dan investasi antara Slovenia dan Amerika Utara. Pada bulan Oktober 1998, Perdana Menteri Janez Drnovšek menjadi kepala negara Slovenia pertama yang mengunjungi Meksiko.[2]
Pada bulan Agustus 2003, kedua negara berpartisipasi dalam Komisi Gabungan untuk Kerja Sama di Bidang Pendidikan dan Kebudayaan. Kedua belah pihak menekankan bahwa sidang Komisi Gabungan ini memberikan kesempatan yang baik untuk membangun fondasi bagi hubungan timbal balik di bidang pendidikan, ilmu pengetahuan, budaya, dan olahraga, serta untuk merefleksikan peran kerja sama internasional sebagai faktor perubahan sosial dan sebagai sarana penting bagi terwujudnya pembangunan global dan berkelanjutan bagi negara-negara. Untuk tujuan ini, para penandatangan memulai program kerja sama untuk periode 2003 hingga 2007, di mana kedua negara menyepakati kolaborasi bersama di bidang pendidikan dasar, menengah, pasca-menengah, dan tinggi; program beasiswa dan pertukaran pelajar.[2]
Kedua negara telah menandatangani beberapa perjanjian bilateral seperti Perjanjian Kerjasama Pendidikan dan Kebudayaan (1996) dan Nota Kesepahaman untuk Pembentukan Mekanisme Konsultasi dalam Hal-hal yang Menjadi Kepentingan Bersama (1996).[4]
Hubungan perdagangan
Pada tahun 1997, Meksiko menandatangani Perjanjian Perdagangan Bebas dengan Uni Eropa (termasuk Slovenia). Pada tahun 2023, perdagangan dua arah antara kedua negara mencapai US$241,8 juta.[5] Ekspor Meksiko ke Slovenia meliputi: bahan kimia, suku cadang mobil, tequila, dan bir. Ekspor utama Slovenia ke Meksiko meliputi: suku cadang mobil dan mesin serta kabel komputer.[5] Beberapa perusahaan Slovenia, seperti Kolektor, saat ini beroperasi di Meksiko.[6]
Konsulat Kehormatan Meksiko di Ljubljana
Kediaman perwakilan diplomatik
Meksiko merangkap sekaligus untuk Slovenia melalui kedutaan besarnya di Wina, Austria dan memiliki konsulat kehormatan di Ljubljana.[7]