Kedua negara menjalin hubungan pada abad ke-19. Belgia mempunyai kedutaan besar di Lima yang juga merangkap sekaligus sebagai perwakilan diplomatik untuk Bolivia dan Ekuador,[1] dan Peru mempunyai kedutaan besar di Brussel yang juga merangkap sekaligus sebagai perwakilan diplomatik untuk Luksemburg dan Uni Eropa.
Belgia adalah mitra dagang keenam Peru di Uni Eropa dan investor Eropa terutama di sektor energi dan transportasi negara tersebut.[2] Kedua negara juga telah menandatangani beberapa perjanjian bilateral.[2]
Misi kemanusiaan Belgia yang disponsori oleh kedutaan tiba di Peru pada tanggal 22 Januari 1965,[4] yang sejak saat itu berfokus pada pekerjaan di daerah pedesaan Peru, membangun infrastruktur dan menyumbangkan barang kepada masyarakat setempat.[5]
Belgia mempertahankan kediaman duta besar di distrik Jesús María[6] hingga dipindahkan ke Barranco pada tahun 2021.[7]