Agama Katolik pertama kali tiba di Filipina pada abad ke-16, bersama para misionaris yang menyertai para conquistador ketika mereka memimpin pulau-pulau tersebut ke Kekaisaran Spanyol. Pada saat Filipina memperoleh kembali kedaulatannya dari Amerika Serikat setelah Perang Dunia Kedua dengan berdirinya Republik Ketiga, agama Katolik telah meninggalkan kesan yang mendalam pada budaya dan masyarakat Filipina, dengan setidaknya tujuh puluh persen penduduk Filipina menganut agama tersebut.
Selama pemerintahan Presiden Filipina Elpidio Quirino, Delegasi Apostolik Filipina ditingkatkan menjadi Nunsiatura, dengan Uskup Agung Egidio Vagnozzi menjadi Nunsius Apostolik pertama pada 9 April 1951. Duta Besar Filipina pertama untuk Takhta Suci, Dr. Manuel Moran, menyerahkan surat kepercayaan kepada Paus Pius XII pada 4 Juni 1951.[3][4][5]
Sejauh ini, tiga Paus telah melakukan kunjungan pastoral ke Filipina. Paus Paulus VI mengunjungi Filipina pada tahun 1970 dan menyampaikan pidato di hadapan mahasiswa di Universitas Santo Tomas (UST) di Manila. Pada tahun 1981, Paus Yohanes Paulus II juga menyampaikan pidato di UST, dan membeatifikasi Lorenzo Ruiz, penduduk asli Manila abad ke-17, menjadi santo di Taman Luneta, beatifikasi pertama yang dilakukan di luar Vatikan. Paus kemudian kembali ke Filipina pada tahun 1995 untuk Hari Orang Muda Sedunia 1995. Pada tanggal 15–19 Januari 2015, Paus Fransiskus melakukan kunjungan ke Filipina, di mana beliau memberikan pidato di UST dan mengunjungi Tacloban, kota yang hancur akibat Topan Haiyan.[6]
Tiga Presiden Filipina menerima Paus di Filipina selama kunjungan apostolik Paus, yaitu Ferdinand Marcos (di 1970 dan 1981), Fidel V. Ramos (pada tahun 1995), dan Benigno Aquino III (pada tahun 2015). Di sisi lain, Presiden Elpidio Quirino (pada tahun 1951), Diosdado Macapagal (1962), Gloria Macapagal Arroyo (pada tahun 2007), dan Benigno Aquino III (pada tahun 2015) diterima oleh Paus dalam audiensi pribadi yang diadakan di Vatikan.[7] Arroyo menghadiri Pemakaman Paus Yohanes Paulus II pada tahun 2005;[8] Marcos Jr. menghadiri Pemakaman Paus Fransiskus pada tahun 2025.[9]
Filipina pernah menjadi tuan rumah Kongres Ekaristi Internasional (IEC) tahun 1937 di Manila dan kembali menjadi tuan rumah pada tanggal 25 hingga 31 Januari 2016, yang diundur dari tanggal semula di bulan Mei atas permintaan Vatikan. Uskup Agung Cebu, Jose S. Palma, dari Konferensi Waligereja Filipina menyarankan kepada Vatikan agar Paus Fransiskus mengunjungi negara tersebut untuk acara tersebut.[10] Namun, Palma kemudian mengkonfirmasi bahwa Paus tidak akan mengunjungi negara itu untuk acara tersebut dan Vatikan malah akan mengirim utusan kepausan untuk berpartisipasi, dengan mengatakan: "IEC adalah kesempatan untuk memuliakan Tuhan. Yang lain mengatakan jika Paus datang, orang mungkin datang karena Paus, bukan karena Yesus."[11]
