Terminal Benowo menjadi titik terminus keberangkatan dari empat jalur trayek angkutan kota Surabaya dan dua jalur trayek angkutan pedesaan lintas perbatasan Surabaya dengan wilayah Gresik atau Sidoarjo. Angkutan kota ini dilayani oleh armada kendaraan Suzuki Carry (station) berpintu samping dengan livery berwarna berbeda pada setiap trayek. Berikut adalah trayek angkutan kota yang beroperasi di Terminal Benowo.[5][6][7]
Sehubungan dengan diresmikannya Angkutan Pengumpan baru yang bernama "Wirawiri Suroboyo" oleh Wali kota Eri Cahyadi per tanggal 2 Maret 2023, angkutan feeder ini dilayani oleh armada kendaraan Toyota Hiace yang melayani rute dari Terminal Benowo dengan layanan operasi jaringan pertama yaitu: