Pembangunan tahap pertama dari terminal ini dilakukan mulai tahun 2010 hingga 2014. Pelayanan kapal domestik perdana kemudian dilakukan pada bulan November 2014, sedangkan pelayanan kapal internasional perdana dilakukan pada tanggal 22 Mei 2015, bersamaan dengan diresmikannya terminal ini oleh Presiden Joko Widodo.
Pada tahun 2021, jumlah kunjungan kapal mengalami peningkatan sebesar 20,97 persen dari tahun 2020 di semester yang sama. Peningkatan kunjungan kapal terjadi karena adanya penambahan perusahaan angkutan laut, antara lain KMTC Line, GSL Line, COSCO Shipping, CMA CGM, dan Evergreen Marine.[1] Pada tanggal 17 Februari 2020, proyek perluasan dermaga peti kemas dari terminal ini dimulai. Dermaga peti kemas rencananya diperluas sebesar 150 meter x 80 meter.[2]