C4d merupakan degradasi dari C4. Setelah aktivasi dan degradasi molekul C4, gugus tio-ester akan tampak dan memungkinkan ikatan antara C4d dengan permukaan sel endotelial dan komponen matriks ekstraselular. C4d juga ditemukan pada intracytoplasmic vacuoles pada sel endotelial. Deteksi C4d dianggap merupakan pertanda tidak langsung dari respon antibodi.[1]