Kepala Badan Pengawas Obat dan Makanan (disingkat Kepala BPOM) adalah pemimpin lembaga nonkementerian Badan Pengawas Obat dan Makanan. Posisi ini dibentuk di pemerintahan presiden Abdurrahman Wahid pada tahun 2001, pertama kali dijabat oleh Sampurno.
Saat ini telah ada 7 pejabat yang pernah menduduki posisi ini. Kepala BPOM saat ini yakni Taruna Ikrar. Berikut adalah daftar orang yang pernah menjabat sebagai Kepala Badan Pengawas Obat dan Makanan.