Agihan dan habitat
Kalong maluku tercatat keberadaannya di pulau-pulau Obi, Bisa (dekat Obi), Buru, Ambon, Seram, Seram Rai, Gorong, Pulau Panjang, Watubela, dan Kofiau (Raja Ampat).[4]
Spesimen di Museum Australia ada yang diperoleh dari area hutan yang terganggu, dari pohon-pohon sagu (Metroxylon), dan dari individu yang mengunjungi sejenis jambu-jambuan (Syzygium) di kebun.[4] Akan tetapi umumnya kalong ini adalah penghuni hutan-hutan yang masih baik kondisinya.[5]