Babak kualifikasi Liga Champions UEFA 1999–2000 dimulai pada 13 Juli 1999. Total ada tiga babak kualifikasi yang menyediakan 16 klub untuk mengikuti babak grup.
Pengundian babak ini dilakukan pada tanggal 30 Juni 1999 di Jenewa, Swiss. Berbeda dengan kualifikasi Liga Champions musim depan, semua pemenang babak sebelumnya diperlakukan sebagai non-unggulan terlepas dari koefisiennya.[1]
Pengundian babak ini dilakukan pada tanggal 23 Juli 1999 di Jenewa, Swiss. Berbeda dengan kualifikasi Liga Champions musim depan, semua pemenang babak sebelumnya diperlakukan sebagai non-unggulan terlepas dari koefisiennya.[1]
