Yan Permenas lahir di Nabire pada tahun 1982, tetapi ia kemudian menghabiskan masa kecilnya di kampung halamannya di Pulau Kurudu, Hal ini dapat dilihat dari nama keluargaMandenas yang merupakan nama keluarga (fam) dari suku Kurudu. Sejak saat itu, ia tinggal bersama tete (kakek) dan nene (nenek), serta juga pernah menjadi nelayan di laut dan menjual hasil tangkapannya di pasar.[2]
Pada tahun 1994, ia harus pindah ke Teluk Bintuni bersama orang tuanya dan bersekolah di SMP Negeri Bintuni karena ayahnya bekerja di sebuah perusahaan kayu di sana.[2]
Pendidikan
S1 Ilmu Administrasi Negara, Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik, Universitas Cenderawasih (2003–2008)
S2 Sosiologi, Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik, Universitas Indonesia (2010–2013)