Pada 20 Juni 2006, Tengku Amalin bergabung dengan Komisi Layanan Kehakiman dan Hukum sebagai pejabat yudisial. Pengadilan Magister Kota Bharu adalah penempatan pertama Tengku Amalin hingga 15 Juli 2009. Salah satu kasus yang ia tangani adalah kasus pengusaha Datuk Nik Sapeia Nik Yusoff yang menyemprotkan cairan kimia berbahaya ke mata mantan Perdana Menteri Malaysia Tun Dr Mahathir Mohamad. Ia juga menerima kritik dari para ulama di Kelantan dan menimbulkan kontroversi di negara bagian tersebut karena menjatuhkan hukuman penjara kepada seorang siswa sekolah agama hanya karena mengenakan sorban saat mengendarai sepeda motor sebelum akhirnya ditangkap oleh penegak hukum di Kubang Kerian pada Januari 2009.[3][4]
Tengku Amalin kemudian ditempatkan sebagai Panitera Senior Wakil dan Wakil Panitera di Pengadilan Tinggi Kuala Lumpur (Sipil) hingga 15 Juli 2012. Tugasnya adalah memeriksa dan memutus sengketa antara pihak-pihak yang berperkara dalam kasus perdata, serta menentukan hukuman bagi mereka jika terbukti bersalah.
Ia melahirkan anak pertama sekaligus putri sulung mereka, Pengiran Anak Tengku Afeefah Musyafaah Bolkiah Putri, pada 13 April 2014. Pada 24 Juni 2016, ia melahirkan anak kedua sekaligus putri kedua mereka, Pengiran Anak Tengku Azzahra Iffatul Bolkiah Putri. Ia melahirkan anak ketiga sekaligus putri ketiga mereka, Pengiran Anak Tengku Zaafirah Muizzah Bolkiah Putri, yang lahir pada 12 Februari 2020.[5] Pada 26 Juni 2022, ia melahirkan anak keempat sekaligus putra pertama mereka, Pengiran Anak Tengku Abdul Muhaimin Bolkiah Petra.
