Stasiun ini dibuka pada tanggal 15 Oktober 1904, dengan nama Stasiun Isoya (磯谷駅code: ja is deprecated , Isoya-eki). Nama stasiun ini diubah menjadi Stasiun Mena pada tanggal 15 Desember 1905. Dengan privatisasi Kereta Api Nasional Jepang (JNR) pada 1 April 1987, stasiun ini berada di bawah kendali JR Hokkaido.
Rencana
Pada bulan Juni 2023, stasiun ini terpilih menjadi salah satu dari 42 stasiun di jalur JR Hokkaido yang dijadwalkan akan dihapus karena rendahnya jumlah penumpang.[1] Diumumkan bahwa dengan revisi jadwal pada 14 Maret 2026, stasiun ini akan dihapus.[2][3]
↑Sugiyama, Junichi (26 June 2023). "「JR北海道が42駅廃止検討」報道、宗谷本線の駅がごっそり消える?"[Report of JR Hokkaido regarding abolition of 42 Stations, majority of which are on the Soya Main Line]. MyNavi Corporation (dalam bahasa Jepang). Diarsipkan dari versi aslinya tanggal 27 June 2023. Diakses tanggal 4 July 2023.
↑"2026年3月ダイヤ改正について"[Regarding the March 2026 timetable revision](PDF). JR Hokkaido (dalam bahasa Jepang). Diakses tanggal 14 January 2026. Pemeliharaan CS1: Status URL (link)
↑"2026年3月ダイヤ改正について"[Regarding the March 2026 timetable revision](PDF). JR Hokkaido (dalam bahasa Jepang). Diakses tanggal 14 January 2026. Pemeliharaan CS1: Status URL (link)