Stasiun Niyama dibuka pada tahun 1943. Dengan privatisasi Kereta Api Nasional Jepang (JNR) pada 1 April 1987, stasiun ini berada di bawah kendali JR Hokkaido.
Rencana
Pada bulan Juni 2023, stasiun ini terpilih menjadi salah satu dari 42 stasiun di jalur JR Hokkaido yang dijadwalkan akan dihapus karena rendahnya jumlah penumpang.[2] Kereta terakhir melayani stasiun tersebut pada tanggal 13 Maret 2026 dan stasiun tersebut ditutup pada hari berikutnya.[3]
↑Ishino, Tetsu (1 October 1998). 停車場変遷大事典 国鉄・JR編 Ⅱ[Station Transition Directory – JNR/JR II] (dalam bahasa Jepang) (Edisi 1st). JTB. hlm.805.
↑Sugiyama, Junichi (26 June 2023). "「JR北海道が42駅廃止検討」報道、宗谷本線の駅がごっそり消える?"[Report of JR Hokkaido regarding abolition of 42 Stations, majority of which are on the Soya Main Line]. MyNavi Corporation (dalam bahasa Jepang). Diarsipkan dari versi aslinya tanggal 27 June 2023. Diakses tanggal 4 July 2023.
↑"JR函館線 仁山駅 廃止を前に住民や鉄道ファンでにぎわう"[JR Hakodate Line's Niyama Station bustled with residents and railway enthusiasts before its closure.]. NHK News Web (dalam bahasa Jepang). Japan. 13 March 2026. Diakses tanggal 14 March 2026.
