Stasiun ini memiliki tiga jalur kereta api. Awalnya, jalur 1 merupakan sepur lurus ditambah satu sepur badug yang dahulu memiliki terusan menuju Bangun Purba dan menyambung di sisi selatan jalur 1. Setelah bangunan baru stasiun ini selesai dibangun, penomoran jalur di stasiun ini diubah sehingga jalur 1 yang lama menjadi jalur 3 yang baru dan jalur 3 yang lama menjadi jalur 1 yang baru.
Kini bangunan baru stasiun ini berbentuk modern dan tidak memakai arsitektur zaman kolonial. Stasiun ini memiliki atap datar dan memiliki ruang tunggu terbuka yang menjadi pusat perhatiannya. Stasiun ini juga merupakan tempat bongkar muat batu-batu balast/kricak untuk digunakan di jalur-jalur kereta api Sumatera Utara.
Sehubungan dengan rencana pengembangan stasiun, saat ini sedang dilakukan perombakan besar-besaran. Bangunan baru dengan peron tinggi dan kanopi yang memayungi jalur 1 sedang dibangun di hadapan bangunan lama. Total Rp39 miliar rupiah sudah digelontorkan untuk proyek ini.[3]
Galeri
Stasiun Loeboek Pakam tempo doeloe
Peron Stasiun Lubuk Pakam
Stasiun Lubuk Pakam baru ketika sedang dalam pembangunan
Tampak depan
Gerbang masuk
Layanan kereta api
Berikut ini adalah layanan kereta api yang berhenti di stasiun ini sesuai Gapeka 2023.[4]
