Sebuah klad yang mencakup Chlorokybus dan Spirotaenia kadang dimasukkan ke dalam kelas ini,[7][8] atau diperlakukan sebagai kelompok saudara, dengan Chlorokybus ditempatkan dalam kelas tersendiri, Chlorokybophyceae.[9]
Dalam lingkup yang lebih luas, Mesostigmatophyceae dapat ditempatkan sebagai kelompok saudari bagi seluruh alga hijau lainnya, atau sebagai saudara bagi seluruh anggota Streptophyta.[10][11][12]
↑Marin, B. & Melkonian, M. (1999). Mesostigmatophyceae, sebuah kelas baru alga hijau streptofit yang diungkap melalui perbandingan urutan SSU rRNA. Protist 150: 399–417, 9 gambar, 2 tabel.
↑Guiry, M.D. & Guiry, G.M. (2007). "Class: Mesostigmatophyceae taxonomy browser". AlgaeBase versi 4.2, publikasi elektronik dunia, National University of Ireland, Galway. Diakses tanggal 23 September 2007.
↑Irisarri, Iker; Darienko, Tatyana; Pröschold, Thomas; Fürst-Jansen, Janine M. R.; Jamy, Mahwash & de Vries, Jan (2021). "Unexpected cryptic species among streptophyte algae most distant to land plants". Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 288 (1963) 20212168. doi:10.1098/rspb.2021.2168. PMC8611356. PMID34814752.