Yemenia didirikan pada 4 Agustus1961 dengan nama Yemen Airlines dan mulai beroperasi pada tahun 1962. Setelah mengalami privatisasi, perusahaan ini kemudian berubah nama menjadi Yemen Airways pada 1972. Nama Yemenia mulai digunakan pada 1 Juli1978. Maskapai penerbangan Yaman SelatanAlyemda bergabung dengan Yemenia pada tahun 1994 setelah Yaman Utara dan Selatan bersatu menjadi Yaman.
Saat ini Yemenia dimiliki Pemerintah Yaman (51%) dan pemerintah Arab Saudi (49%).