Fitzgerald ditahbiskan menjadi imam pada 16 Mei 1918.[2] Setelah mengajar di institusi selama tiga tahun berikutnya, ia menjadi presiden Universitas Gonzaga pada 1921, menjabat dalam jabatan tersebut sampai 1927.[1] Setelah itu, ia menjabat sebagai presiden Manresa Hall di Port Townsend (1927–29) dan Kolese Seattle (1929–31). Ia kemudian menjabat sebagai wakil provinsial (1931–32) dan kemudian provinsial (1932–38) dari Provinsi Barat Laut Yesuit.[1]