UWM terdiri dari empat fakultas yang mengelola 10 program studi dengan jenjang studi Strata 1 (S1).
Fakultas Sains dan Teknologi (FST)
Program Studi Arsitektur (Terakreditasi B)
Program Studi Teknik Industri (Terakreditasi B)
Program Studi Teknologi Pangan (Terakreditasi B)
Fakultas Hukum (FH)
Program Studi Hukum (Terakreditasi B)
Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik (FISIPOL)
Program Studi Ilmu Administrasi Publik (Terakreditasi B)
Program Studi Sosiologi (Terakreditasi B)
Program Studi Ilmu Komunikasi (Terakreditasi)
Fakultas Ekonomi (FE)
Program Studi Akuntansi (Terakreditasi B)
Program Studi Manajemen (Terakreditasi B)
Program Studi Kewirausahaan
Fasilitas
Kampus
Lokasi kampus I UWM beralamat di Ndalem Mangkubumen, Ngasem KT III/237 Yogyakarta 55132.
Kampus Terpadu Universitas Widya Mataram beralamat di Jl. Tata Bumi Selatan RW No.84B, RW.rt 02, Onggobayan, Ngestiharjo, Kec. Kasihan, Kabupaten Bantul, Daerah Istimewa Yogyakarta 55293
Lembaga
Lembaga Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat (LPPM)
Lembaga Penjaminan Mutu (LPM)
Lembaga Pusat Pengembangan Karier (PPK)
Laboratorium
Laboratorium Komputer
Laboratorium Bahasa
Laboratorium Perencanaan dan Perancangan Kota, Daerah dan Pemukiman
Laboratorium Perancangan Arsitektur
Laboratorium Fisika Lingkungan
Laboratorium Sistem Kerja dan Ergonomi
Laboratorium Sistem Produksi
Laboratorium Proses Manufaktur
Laboratorium Kimia Pangan
Laboratorium Mikrobiologi dan Teknologi Pengolahan Hasil Pertanian
Laboratorium Hukum
Pusat studi
Pusat Studi Arsitektur Tradisional
Pusat Studi Pengembangan Masyarakat Sipil
Pusat Studi Pengembangan Ekonomi dan Teknologi Pangan