Dalam beberapa tahun terakhir, Teluk Manado menghadapi tantangan lingkungan, seperti dampak reklamasi pantai dan isu kerusakan ekosistem terumbu karang. Beberapa pihak telah melakukan kajian untuk memahami dan mengatasi dampak dari perubahan tersebut.[5][6]
Wikimedia Commons memiliki media mengenai Manado Bay.