Apabila seorang warga Mesir tersangka terorisme bernama Anwar El-Ibrahimi (Omar Metwally) hilang lenyap selama penerbangan dari Afrika Selatan ke Washington, D. C., istrinya rakyat Amerika, Isabella (Reese Witherspoon), bepergian ke Washington mencari sebab dan penyebab kehilangan suaminya. Sementara itu, di sebuah pusat tahanan rahasia di luar Amerika Serikat, analis CIA, Douglas Freeman (Jake Gyllenhaal) dipaksa untuk menanyai siasat terhadap penyiksaan El-Ibrahimi.
Diawal film ketika Anwar menelepon Isabelle yang tinggal di Chicago, Amerika Serikat dari Cape Town, Afrika Selatan terlihat didinding tempat Anwar menelepon jam menunjukkan jam 1 siang sementara ditempat Isabelle masih siang. Padahal perbedaan waktu antara Cape Town dan Chicago itu 8 jam sehingga seharusnya keadaan di Chicago ketika Anwar menelepon sudah malam.