Riwayat jabatan
Kariernya dimulai sebagai Pamapta Kepolisian Resort Kota Surabaya Timur pada tanggal 8 Desember 1987. Pada tanggal 27 Desember 1988, ia diangkat menjadi Wakil Kepala Satuan Serse Kepolisian Resort Kota Surabaya Timur, kemudian pada tanggal 12 Desember 1990 menjabat sebagai Kepala Unit Internasional Kriminal Satuan IPP Kepolisian Wilayah Kota Besar Surabaya. Tanggal 2 Desember 1992, ia dipercaya sebagai Kepala Satuan Intelijen Pengamanan Kepolisian Resor Mojokerto.
Pada tanggal 27 Desember 1997, ia menjadi Kepala Satuan Operasi Pusat Komando Pengendalian Operasi Kepolisian Daerah Kalimantan Tengah, serta menjabat sebagai Perwira Bantuan Muda Pada Perwira Bantuan IV/Keamanan Asisten Intelijen Kepolisian Republik Indonesia tanggal 21 Desember 1998. Pada tanggal 1 April 2000, ia bertugas sebagai Kepala Kepolisian Sektor Metropolitan Menteng.
Selanjutnya, pada tanggal 1 Desember 2000, Paulus Waterpauw menjabat sebagai Kepala Pusat Komando Pengendalian Operasi Kepolisian Resor Metropolitan Jakarta Pusat. Ia kemudian diangkat sebagai Wakil Kepala Kepolisian Resor Tangerang pada tanggal 5 September 2001, dan tanggal 8 Mei 2002 menjadi Perwira Menengah dalam rangka mengikuti pendidikan di Sekolah Staf dan Pimpinan.
Pada tanggal 14 Desember 2002, ia menjadi Kepala Kepolisian Resor Mimika. Pada tanggal 21 Oktober 2005, ia diangkat menjadi Kepala Kepolisian Resor Kota Jayapura. Pada tanggal 17 Februari 2006, ia menjabat sebagai Direktur Reserse Kriminal Kepolisian Daerah Papua dan pada tanggal 13 Februari 2009 menjabat sebagai Penyidik Utama Tingkat II Direktorat III/Korupsi dan White Collar Crime Badan Reserse Kriminal Polri. Pada tanggal 24 Agustus 2010, ia juga menjabat sebagai Widyaiswara Madya Sekolah Staf dan Pimpinan Polri.
Pada tanggal 29 September 2010, ia bertugas sebagai Widyaiswara Madya Sespim Polri. Pada tanggal 19 Oktober 2011, ia menjabat sebagai Wakil Kepala Kepolisian Daerah Papua.[4]
Pada tanggal 19 Desember 2014, ia diangkat menjadi Kepala Kepolisian Daerah Papua Barat. Pada tahun 30 Juli 2015, ia diangkat menjadi Kepala Kepolisian Daerah Papua, dan pada tanggal 18 April 2017 menjabat sebagai Wakil Kepala Badan Intelijen Keamanan Polri. Pada tanggal 2 Juni 2017, ia juga menjabat sebagai Kepala Kepolisian Daerah Sumatera Utara.[5] Pada tanggal 13 Agustus 2018, Paulus Waterpauw dipercaya sebagai Tenaga Ahli Bidang Hukum dan Hak Asasi Manusia Lembaga Ketahanan Nasional.
Pada tanggal 14 Oktober 2018, ia menjabat sebagai Analis Kebijakan Utama Bidang Sekolah Staf dan Pimpinan Tinggi Lembaga Pendidikan dan Latihan Polri. Pada tahun 27 September 2019, ia diangkat menjadi Kepala Kepolisian Daerah Papua. Pada tahun 18 Februari 2021, ia juga menjabat sebagai Kepala Badan Intelijen Keamanan Polri.[6]