Pakiam lahir di Tapah, Perak dan ditahbiskan menjadi imam pada 10 Mei 1964. Ia diangkat menjadi uskup agung metropolitan Kuala Lumpur pada 24 Mei 2003, dan dilantik lima hari kemudian. Pakiam adalah mantan presiden Konferensi Uskup Katolik Malaysia, Singapura, dan Brunei; dan penerbit surat kabar mingguan Katolik, The Herald.
Pada tahun 2007, Pakiam mengajukan peninjauan yudisial setelah "The Herald" diperintahkan untuk berhenti menggunakan kata Arab "Allah" dalam publikasinya oleh pemerintah Malaysia. Pada tahun 2009, Pengadilan Tinggi membatalkan larangan pemerintah terhadap kata tersebut. Pada tahun 2010, ia menerima permintaan maaf publik dari majalah "Al-Islam", yang telah mengirim dua wartawan ke sebuah gereja Katolik setahun sebelumnya, di mana mereka melakukan penodaan terhadap Ekaristi.