Setelah peristiwa Anschluss (ketika Austria diambil alih oleh Jerman Nazi, aparat Nazi mendeportasi Figl ke kamp konsentrasi Dachau pada tahun 1938. Ia dilepaskan dari kamp tersebut pada Mei 1943. Ia lalu bekerja sebagai seorang insinyur minyak bumi, tetapi pada Oktober 1944 Figl ditangkap lagi dan dijebloskan ke kamp konsentrasi Mauthausen. Setelah kekalahan Nazi, Figl dibebaskan dan panglima militer Uni Soviet, Tolbukhin, meminta Figl untuk mengatur persediaan makanan untuk rakyat Wina.[1]