Basilika ini dibangun di lokasi kuil Romawi kuno.[2] Dihancurkan oleh bangsa Normandia pada tahun 1060, bangunan ini dibangun kembali dan didedikasikan untuk Santa Maria degli Angeli pada tahun 1127. Sejak itu 1258 Basilika menyimpan relik Santo Thomas. Katedral ini mengalami kerusakan akibat serangan militer Ottoman pada tahun 1566, Prancis pada tahun 1799, dan pertempuran selama Pertempuran Ortona tahun 1943.[3]
