Kabupaten Baucau adalah sebuah bekas kabupaten yang pernah berdiri di provinsiTimor Timur, Indonesia pada masa pendudukan dahulu, antara tahun 1976-1999. Setelah Timor Timur merdeka dari Indonesia, daerah definisi Kabupaten Baucau dilanjutkan oleh Distrik Baucau dengan pusat pemerintahan berada di Kota Baucau.