Junisaf lahir dari pasangan Anwar Maharaja Sutan (ayah) dan Siti Safiah (ibu), yang berasal dari Sumatera Barat. Ayahnya pernah jadi demang di Kerinci dan Padang pada masa kolonial Belanda.
Beberapa orang kakak dan adiknya juga menjadi tokoh yang dikenal masyarakat, yaitu Johnny Anwar, seorang polisi yang pernah menjabat Panglima Angkatan Kepolisian (Pangak) XVIII Sulawesi Selatan-Tenggara, Rosihan Anwar, seorang tokoh wartawan dan pendiri koran Pedoman, Roesman Anwar, seorang profesional yang pernah menjabat sebagai Direktur Utama Pelni serta adik bungsunya Yozar Anwar, seorang pemimpin aktivis gerakan mahasiswa pada tahun 1966 yang kemudian juga berkarier sebagai wartawan dan penulis buku.[3]
