| Nama Penjabat | Periode | Keterangan |
| Drs. Munawar, M.Si. | 2003-2006 | Ketua Pengelola STAIN Pontianak Filial Sambas |
| Drs. H. Jamiat Akadol, M.Si. | 2006-2010 | Ketua STIT Sambas |
| Drs. H. Jamiat Akadol, M.Si. | 2010-2014 | Ketua STAI Sambas |
| Dr. H. Jamiat Akadol, M.Si.M.H. | 2014-2018 | Rektor IAIS Sambas |
| Dr. H. Jamiat Akadol, M.Si. M.H. |
2018-2022 |
Rektor IAIS Sambas |
Dr. H. Arnadi, M.Pd. 2022 - 2026
FAKULTAS DAN SEKOLAH PASCASARJANA
UNISSAS memiliki 4 fakultas, 1 program studi diploma, 15 program studi sarjana, dan 2 program studi pascasarjana.[3] Setiap fakultas dijalankan oleh Dekan, Wakil Dekan, Ketua Program Studi, Sekretaris Program Studi, UPT Praktek Kerja Lapangan, UPT Penerbitan dan Publikasi Ilmiah, Unit Penjaminan Mutu (UPM), Laboratorium, Sub-bagian Tata Usaha dan Dosen. Sedangkan Sekolah Pascasarjana dijalankan oleh Direktur, Wakil Direktur, Ketua Program Studi, Sekretaris Program Studi, Unit Penjaminan Mutu (UPM) dan UPT Penerbitan dan Publikasi Ilmiah.
SEKOLAH PASCASARJANA
- S2 Magister Pendidikan Agama Islam
- S2 Magister Ekonomi Syariah
FAKULTAS PENDIDIKAN
- S1 Pendidikan Agama Islam
- S1 Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah
- S1 Pendidikan Islam Anak Usia Dini
- S1 Pendidikan Bahasa Indonesia
- S1 Pendidikan Matematika
FAKULTAS EKONOMI DAN BISNIS
- D3 Perbankan Syariah
- S1 Ekonomi Syariah
- S1 Manajemen Bisnis Syariah
- S1 Akuntansi Syariah
FAKULTAS HUKUM
- S1 Hukum Tata Negara
- S1 Hukum Ekonomi Syariah
FAKULTAS STUDI ISLAM
- S1 Bimbingan dan Penyuluhan Islam
- S1 Komunikasi dan Penyiaran Islam
- S1 Sejarah dan Peradaban Islam
- S1 Ilmu al-Qur'an dan Tafsir
- S1 Ilmu Perpustakaan dan Informasi
Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LP2M)
LP2M IAIS Sambas memiliki struktur sebagai berikut:
- Ketua
- Sekretaris
- Pusat Penelitian
- Pusat Pengabdian Pada Masyarakat
- Pusat Penerbitan dan Publikasi Ilmiah
- Pusat Studi Gender dan Anak
- Pusat Studi Halal
- Pusat Studi Islam Asia Tenggara
Biro Administrasi Umum, Akademik, dan Kemahasiswaan (BAUAK)
Biro AUAK IAIS Sambas membawahi beberapa bagian sebagai berikut:
- Bagian Akademik dan Kemahasiswaan
- Bagian Umum dan Kepegawaian
- Bagian Keuangan dan Aset
Pusat Latihan dan Layanan Bahasa (PUSLALBA)
PUSLAPBA IAIS Sambas merupakan unsur penunjang akademik dalam hal pelatihan dan pelayanan tes bahasa. Strukturnya sebagai berikut:
- Kepala
- Sekretaris
- Instruktur dan Laboran
Pusat Pelatihan dan Pembinaan Keagamaan (PUSLATBIMA)
PUSLATBIMA IAIS Sambas merupakan unsur penunjang akademik dalam hal pelatihan dan pembinaan keagamaan bagi mahasiswa. Strukturnya sebagai berikut:
- Kepala
- Sekretaris
- Instruktur dan Laboran
Perpustakaan
Perpustakaan IAIS Sambas memiliki struktur organisasi sebagai berikut:
- Kepala
- Sekretaris
- Pustakawan
PUSDATIN IAIS Sambas adalah unsur penunjang akademik di bidang pengelolaan dan pengolahan data elektronik serta pengelola jaringan intranet dan internet. Strukturnya sebagai berikut:
- Kepala
- Sekretaris
- Instruktur, Laboran, dan Operator.
Lembaga Penjaminan Mutu (LPM)
LPM IAIS Sambas memiliki struktur organisasi sebagai berikut:
- Ketua
- Sekretaris
- Pusat Akreditasi, Sertifikasi dan Standardisasi Mutu
- Pusat Peningkatan Mutu Pendidikan dan Pengajaran
- Pusat Pengawasan dan Audit Internal / SPMI
Organisasi Kemahasiswaan
Organisasi Kemahasiswaan IAIS Sambas terdiri dari:
- Dewan Perwakilan Mahasiswa (DPM)
- Badan Eksekutif Mahasiswa (BEM) Institusi dan Fakultas
- Unit Kegiatan Mahasiswa (UKM)
- Unit Kegiatan Khusus (UKK)
- Himpunan Mahasiswa Program Studi (HIMAPRODI)
Pimpinan
Berikut ini adalah unsur pimpinan IAIS Sambas periode 2018-2022.[4]
{{| class="wikitable" |
Nama |
Jabatan |
| Dr. H. Jamiat Akadol, M.Si., M.H. |
Rektor |
| Dr. H. Sumar'in, S.E.I., M.S.I. |
Wakil Rektor Bidang Akademik dan Pengembangan Kelembagaan |
| Oskar Hutagaluh, S.Pd., M.M., M.Si. |
Wakil Rektor Bidang Administrasi Umum, Keuangan, dan Kepegawaian |
| Dr. Alkadri, S.Ag., M.Ag. |
Wakil Rektor Bidang Kemahasiswaan, Alumni, dan Kerja Sama |
| Dr. H. Arnadi, M.Pd. |
Direktur Pascasarjana |
| Dr. Hifza, M.S.I. |
Dekan Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan |
| Dr. Sunandar, M.Hum. |
Dekan Fakultas Dakwah dan Humaniora |
| Dr. Zarul Arifin, M.S.I. |
Dekan Fakultas Syariah |
| Dr. Sri Deti, S.E., M.E.I. |
Dekan Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam |
| Dr. H. Karman, M.Si., M.H. |
Ketua Lembaga Penjaminan Mutu |
| Dr. Aslan, M.Pd.I. |
Ketua Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat |
| Iwan Kusnadi, S.E., M.E. |
Kepala Biro Administrasi Umum, Akadmeik, dan Kemahasiswaan |
| H. Thamrin, S.IP., M.H. |
Kepala Satuan Pengawas Internal |
| Zulfikar, S.T., M.I.P. |
Kepala Perpustakaan |
| M. Sabiqul Huda, S.Pd., M.Pd. |
Kepala Pusat Pelatihan dan Pelayanan Bahasa |
| H. Nashirun, Lc., M.E. |
Kepala Pusat Pelatihan dan Pembinaan Keagamaan |
| Irhas Nur Huda, S.H. |
Kepala Pusat Pangkalan Data dan Informasi |