Pada tahun 2021, Vicky Ward dalam majalah Rolling Stone mengabarkan bahwa Epstein terkait dengan badan-badan intelijen, dan ia pernah membanggakan kepada seorang jurnalis bahwa ia mengenal pemilik pelabuhan Jibuti di Afrika dengan sangat baik sehingga dapat menggunakannya untuk penyelundupan.[1]
Sebagai jaksa AS di Florida, Alexander Acosta—yang kemudian menjadi Menteri Tenaga Kerja AS—mencapai kesepakatan dengan pengacara Epstein pada tahun 2008, yang memungkinkan Epstein menerima hukuman penjara yang ringan. Acosta dilaporkan kemudian menyatakan bahwa ia diberitahu bahwa Epstein "terkait dengan intelijen" dan bahwa masalah tersebut berada di luar wewenangnya. Menurut Acosta, ia "dipaksa" untuk memberikan kesepakatan yang sangat menguntungkan bagi Epstein.[2] Mantan Direktur CIA dan diplomat William J. Burns bertemu dengan Epstein tiga kali. Menurut juru bicara CIA, Burns berharap Epstein dapat membantunya "beralih ke sektor swasta".[3][4]
Ghislaine Maxwell mengklaim dalam wawancara penjara Juli 2025 dengan Todd Blanche bahwa kisah keterlibatan Epstein dengan badan intelijen selama hubungannya dengannya adalah "omong kosong".[5] Sebelumnya, Maxwell menyatakan bahwa pesawat-pesawat Epstein "disadap" untuk "mendapatkan keuntungan", dan dalam percakapan dengan Christina Oxenberg, ia menduga bahwa rekaman audio dan video berpotensi menjerat rekan-rekan konspirator dan tokoh-tokoh terkemuka yang terkait dengan Epstein.[6]
Israel
Jurnalis Dylan Howard, Melissa Cronin, dan James Robertson mengaitkan Epstein dengan Mossad Israel dalam buku mereka Epstein: Dead Men Tell No Tales. Mereka sebagian besar mengandalkan mantan petugas intelijen Israel, Ari Ben-Menashe.[7] Aktivitas Epstein yang diduga sebagai mata-mata Israel bertujuan untuk mengumpulkan materi yang merugikan tentang orang-orang berkuasa guna memeras mereka.[8] Korban Epstein, Virginia Giuffre, menuduh Epstein sebagai aset intelijen, dengan mengunggah tautan ke halaman Reddit di Twitter yang mengklaim Epstein adalah mata-mata Mossad/CIA yang mengoperasikan jaringan pemerasan dan perangkap untuk menjebak oligarki elit.[9] Beberapa orang berpendapat bahwa kecil kemungkinannya ia bekerja untuk Mossad.[10][11]
Menurut email yang terungkap pada November 2025, seorang perwira intelijen Israel menginap di apartemen Epstein di Manhattan beberapa kali antara tahun 2013 dan 2016. Pada 2016, pemerintah Israel memasang peralatan keamanan di sebuah gedung di Manhattan yang dimiliki oleh saudaranya dan dikelola oleh Epstein, untuk digunakan oleh rekan-rekannya dan model di bawah umur; mantan Perdana Menteri Israel Ehud Barak sering menginap di gedung tersebut untuk jangka waktu yang lama.[12] Email-email tersebut juga menunjukkan bahwa Epstein terlibat dalam negosiasi perjanjian keamanan antara Israel dan Mongolia serta antara Israel dan Pantai Gading. Epstein juga berusaha membangun saluran rahasia antara pemerintah Rusia dan Israel selama Perang Saudara Suriah.[13][14]
Rusia
Pada tahun 2026, Perdana Menteri Polandia Donald Tusk mengumumkan bahwa ia ingin melihat penyelidikan terhadap "kemungkinan" hubungan antara Epstein dan otoritas Rusia.[15][16] Epstein berulang kali membanggakan diri telah memberi nasihat kepada "para pemimpin asing yang meliputi Vladimir Putin, Muhammad bin Zayid, Muhammad bin Salman, berbagai diktator Afrika, Israel, Inggris — dan, tentu saja, Amerika" pada dekade terakhir hidupnya.[1][17]
John Mark Dougan adalah wakil sheriff County Palm Beach (tempat Epstein pertama kali ditangkap) hingga ia diberhentikan pada tahun 2009. Dia kemudian direkrut oleh badan intelijen Rusia dan bekerja sebagai penyebar disinformasi atas nama pemerintah Rusia.[18][19] Menurut laporan media Inggris, Dougan mungkin telah memperoleh sebagian dari kompromat milik Epstein, yang diduga telah ia salin dan serahkan kepada Rusia. Badan intelijen lain mungkin juga telah memperoleh materi tersebut.[20]
Amerika Serikat
Menurut laporan tahun 2025 oleh Drop Site News, Les Wexner dan Epstein terlibat dalam pemindahan Southern Air Transport (sebuah organisasi kedok CIA yang terkait dengan skandal Iran Contra dan dugaan penyelundupan narkoba oleh CIA) dari Miami ke Columbus pada tahun 1990-an. Southern Air mengangkut barang-barang yang terkait dengan bisnis Wexner, tetapi pada tahun 1996, petugas Bea Cukai menemukan kiriman kokain yang disembunyikan di salah satu pesawatnya. Southern Air ditutup pada tahun 1998 setelah Wexner menerima bantuan federal untuk relokasi maskapai tersebut, hanya beberapa minggu sebelum Inspektur Jenderal CIA merilis temuan resminya mengenai dugaan perdagangan kokain Contra. Pada tahun 1980-an, Epstein sendiri memiliki hubungan dekat dengan tokoh-tokoh kunci dalam skandal Iran-Contra, seperti Stanley Pottinger dan Adnan Khashoggi.[21]
12Ward, Vicky (July 15, 2021). "Was Jeffrey Epstein a Spy?". Rolling Stone. Diarsipkan dari versi aslinya tanggal November 27, 2021. Diakses tanggal January 7, 2024.