Kriteria

Aspek yang dipakai dalam penilaian Miss Indonesia 2006 adalah C2B2, yaitu:

• Cantik: Seorang Miss Indonesia haruslah cantik luar dalam
• Cerdas: Seorang Miss Indonesia haruslah cerdas, baik tutur kata maupun dalam keseharian
• Berbakat: Seorang Miss Indonesia haruslah berbakat
• Berbudi: Seorang Miss Indonesia haruslah menjadi contoh yang baik, mempunyai sopan santun, etika, dan berbudi luhur

Dewan juri

Dewan juri Miss Indonesia 2006 terdiri dari:

• Sutanto Hartono – Wakil Presiden Direktur RCTI
• Liliana Tanaja Tanoesoedibjo – Pendiri Yayasan Miss Indonesia
• Martha Tilaar – Pakar kecantikan
• Pia Alisjahbana – Tokoh media
• Wimar Witoelar – Pengamat sosial
• Samuel Mulia – Pengamat fesyen
• Larasati Iris Rischka Gading – Model
• M, Firman Ichsan – Fotografer
• Manoj Punjabi – Pebisnis hiburan
• Yuddy Chrisnandi – Anggota DPR RI

Hadiah

Miss Indonesia 2006 menerima hadiah uang sebesar Rp50 juta, sementara Runner-up I menerima hadiah uang sebesar Rp25 juta dan Runner-up II menerima hadiah uang sebesar Rp 15 juta.

Pernah berkompetisi

Beberapa delegasi dari Miss Indonesia 2006 telah berpartisipasi, atau akan berpartisipasi dalam kontes nasional dan internasional penting lainnya:

Puteri Indonesia

• 2004:  Bali: Putu Yunita Oktarini (5 besar)
• 2005:  Riau: Nia Permatasari Sastradipura (10 besar)
• 2005:  Kalimantan Tengah: Ayesha Vaniaku Liharfin

Putri Pariwisata Indonesia

• 2008:  Maluku: Albertina Fransisca Mailoa (pemenang)
• 2008:  Aceh: Cut Nadira Sari (runner-up I)
• 2008:  Sumatera Barat: Eva Riani
• 2009:  Lampung: Devinca Ana Sanya

Wajah Femina

• 2004:  DKI Jakarta: Dwi Ayu Ross Miranty (pemenang Busana Nasional)
• 2008:  Lampung: Devinca Ana Sanya

Miss Indonesia Tourism

• 2007:  Maluku: Albertina Fransisca Mailoa (Indonesia World Miss University)

World Miss University

• 2007:  Maluku: Albertina Fransisca Mailoa

Miss Tourism Pageant

• 2007:  Lampung: Devinca Ana Sanya