Maskapai penerbangan ini didirikan dan memulai operasinya tahun 1942 sebagai agensi Aeroflot, dengan nama Moscow Aviation Enterprise. Kegunaan maskapai ini adalah untuk mengirim suku cadang pesawat. Tahun 1962 maskapai ini mulai mengoperasikan pesawat kargo, dan pada tahun 1980 telah memiliki armada 29 pesawat yang beroperasi di seluruh Uni Soviet dan mengubah nama menjadi Transport Aviation.
Tahun 1990 perusahaan ini didirikan sebagai maskapai independen pertama di Uni Soviet dan pada waktu yang sama mengubah nama menjadi Aviatrans. Kemudian berdiri sebagai persahaan terbatas umum pribapada tahun 1993. Nama ATRAN telah digunakan sejak Januari 1997. Sahamnya dimiliki oleh karyawannya (73%), negara Rusia (25%) dan perusahan umum (2%).[2]
12(Rusia) Federal State Unitary Enterprise "State Air Traffic Management Corporation", Airline Reference, Vol. 1, Russian Federation, 1 June 2007, p. 99
