Ia terdorong oleh kebutuhan keuangan, disebabkan antara lain oleh ganti rugi perang yang dituntut oleh Roma, untuk mengejar kebijakannya yang ambisius. Dalam upaya mengumpulkan uang untuk membayar orang-orang Romawi, dia mengutus menteri Heliodorus ke Yerusalem untuk merampas harta Bait Suci Yahudi.
Pajak dan pembunuhan
Koin Seleukos IV Filopator, stempel Yunani: (Β)ΑΣΙΛΕΩΣ (ΣΕ)ΛΕΥΚΟΥ
Alkitab menceritakan sebuah nubuat yang diberikan oleh malaikat utusan dalam Daniel 11:20. Teks itu menyatakan bahwa Seleukos akan dikenang sebagai "yang menyuruh seorang pemungut pajak menjalani bagian yang terindah dari kerajaan itu." Deuterokanonika memuat lebih banyak mengenai hal ini dalam 2 Makabe 3:2-3... "Terjadilah bahwa bahkan raja-raja mereka sendiri, dan para pangeran menghormati tempat itu [Bait Suci di Yerusalem] layak menerima kehormatan tertinggi, dan memuliakan Bait Suci itu dengan hadiah-hadiah sangat besar: Sehingga Seleukos raja Asia memperbolehkan dari pendapatannya semua harga menjadi milik kementerian pengorbanan."
Sekembalinya dari Yerusalem, Heliodorus membunuh Seleukos, dan merebut tahta untuk dirinya sendiri. Pewaris sejati, Demetrius, anak Seleukos, saat itu ditahan di Roma sebagai sandera, dan kerajaan itu direbut oleh adik Seleukos, Antiokhos IV Epiphanes. Antiokhos berhasil menggulingkan Heliodorus dan mengangkat anak bayi Seleukos, juga bernama Antiokhos, resmi menjadi kepala negara selama beberapa tahun sampai Epifanes telah dia dibunuh.
