Plot
Shaquille O'Neal dan Dr. Phil terbangun dan mendapati diri mereka dirantai ke pipa di kamar mandi. Sebuah boneka jahat muncul di layar televisi dan menunjukkan bahwa ruangan itu perlahan terisi gas saraf. Untuk melarikan diri, Shaquille harus menembak keranjang untuk mendapatkan dua gergaji besi, yang ditujukan untuk memotong kaki mereka. Namun, Dr. Phil memotong kaki yang salah dan pingsan, menyebabkan keduanya tewas.
Sementara itu, Cindy Campbell mengunjungi saudara iparnya, Tom Logan, di New York City. Suaminya, George, telah meninggal dunia, dan keponakannya, Cody, terdaftar di akademi militer, membuatnya patah hati dan kesepian. Upaya bunuh diri Tom mengakibatkan ia menelan viagra, yang membuat penisnya membengkak dan menyebabkan kematiannya ketika ia jatuh dari pagar pembatas.
Setelah itu, Cindy bekerja merawat Nyonya Norris, yang tinggal di rumah berhantu. Tetangganya, Tom Ryan, yang bertemu dengan teman-teman George, Mahalik dan CJ, dan mengetahui tentang hubungan homoseksual mereka. Tom disambut oleh kedatangan anak-anaknya yang telah lama terpisah, Robbie dan Rachel.
Keesokan harinya, Cindy menjalin hubungan dengan Tom, menceritakan kepadanya tentang kematian George dalam pertandingan tinju. Mereka berdua menyadari cinta mereka, tetapi diganggu oleh tripod raksasa yang mulai menguapkan penduduk kota.
Cindy bercakap dalam bahasa Jepang, dengan hantu di rumah tersebut, seorang anak laki-laki pendiam berkulit pucat, dan menyadari bahwa jawaban atas invasi tersebut adalah hati ayahnya. Sementara Tom meninggalkan kota bersama anak-anaknya, Cindy bertemu kembali dengan temannya, Brenda Meeks, yang entah kenapa masih hidup setelah meninggal di film sebelumnya. Mengikuti arahan anak laki-laki Jepang itu, mereka menuju ke pedesaan dan berakhir di sebuah komunitas misterius yang terisolasi. Mereka ditangkap dan diadili, dipimpin oleh Henry Hale. Hasilnya memungkinkan mereka untuk hidup, tetapi tidak boleh meninggalkan desa.
Sementara itu, ada rapat darurat PBB yang dipimpin oleh Presiden Amerika Serikat yang eksentrik, Baxter Harris, yang enggan berhenti membaca "My Pet Duck". Rapat tersebut menjadi kacau ketika senjata pembasmi alien yang tidak berfungsi membuat semua orang telanjang.
Tom dan anak-anaknya berkendara di tengah perang antara militer dan alien. Gembira dengan konflik tersebut, Robbie melarikan diri, sementara tripod menangkap Tom dan Rachel. Kembali di desa, Henry dibunuh oleh orang gila desa, Ezekiel, yang memberi tahu Cindy bahwa Henry adalah ayah dari anak laki-laki Jepang, yang terbunuh saat pertandingan tinju Cindy.
Cindy dan Brenda ditangkap oleh tripod dan dibawa ke kamar mandi yang terlihat di prolog. Mereka terjebak di tanaman Venus flytrap dari Saw II. Cindy berhasil melewati tantangan boneka tersebut, tetapi keselamatan Tom dan anak-anaknya terancam. Melihat toilet dengan "jantung" di dekatnya, Cindy menyadari bahwa Boneka tersebut adalah ayah kandung sebenarnya dari anak laki-laki Jepang tersebut.
Melihat betapa jauhnya Tom berjuang untuk menyelamatkan anak-anaknya, Boneka itu, menyadari kesalahannya, meminta maaf atas invasi tersebut dan melepaskan mereka. Robbie dan Rachel berhasil kembali kepada ibu mereka, yang ternyata telah menikah dengan pria yang jauh lebih tua. Brenda juga menjalin hubungan asmara dengan saudara manusia Boneka itu, Zoltar.
Epilog yang berlatar satu bulan setelahnya, dinarasikan oleh James Earl Jones yang kemudian tertabrak bus, mengungkap Brenda melahirkan anaknya dengan Zoltar, Mahalik dan CJ melanjutkan hubungan mereka, dan Presiden Harris merasa puas dengan bebeknya. Sementara itu, Tom muncul di The Oprah Winfrey Show dan dengan liar menyatakan cintanya kepada Cindy dengan melompat-lompat, melempar Cindy ke seberang ruangan, lalu mematahkan pergelangan tangan Oprah dan memukulnya dengan kursi.
