Dari 2014 sampai 2019, ia menjadi kapelan senior di Katedral Kota Cebu serta dekan dan anggota dewan staf keuskupan. Dari 2017, Labajo menjadi anggota Dewan Penasehat,[1] vikaris episkopal Distrik I,[3] dan anggota Dewan Imam.[1][3] Sejak 2020, ia menjabat sebagai vikaris jenderal Keuskupan Agung Cebu dan kapelan senior di Paroki Santo Fransiskus Asisi, Balamban.[1]