Awal berdiri

Pada zaman Hindia Belanda, klub sepak bola didirikan di Manado dengan nama MIVB (Manadosche Indonesische Voetbal Bond). Sayangnya, tidak banyak sumber yang menceritakan tentang sejarah dan kiprah klub tersebut.^[4] Pada tahun 1960 dibentuklah klub sepak bola yang diberi nama Persma (Persatuan sepak bola Manado) sebagai satu klub perserikatan sepak bola yang ada di Manado, dan dikelola oleh pemerintah daerah menggunakan APBD.

Era Persma

Pada tahun 1995 salah satu tim besar Eropa yang berasal Belanda, PSV Eindhoven, menyambangi Stadion Klabat untuk menggelar partai persahabatan menghadapi Persma Manado. Pemain sekelas Ronaldo, Philip Cocu dan Boudewijn Zenden, beradu kekuatan dengan pemain Persma Manado seperti Rodrigo Araya, Francis Wewengkang, Jan Kaunang, Maxi Warokka juga Izack Fatari.^[5]

Di musim 1995–1996, Persma melakukan perombakan dengan mendatangkan pemain-pemain asal Kamerun yang pernah bertanding di ajang Piala Dunia FIFA seperti Jules Denis Onana, Ernest Ebongué dan Jean-Pierre Fiala. Pada tahun 1996 tim Sepak bola Sulawesi Utara yang berlaga di PON XIV Jakarta meraih medali perunggu yang kemudian sebagian besar pemain di tim ini menjadi pemain yang mengisi skuad Persma Manado. Nama-nama seperti Hendra Pendeynuwu, Rahman Bereki, hingga Alen Mandey menjadi pemain-pemain yang berlaga di Stadion Gelora Senayan saat itu yang kemudian menjadi penggawa tim yang berjuluk Badai Biru.^[6]

Setelah Reformasi 1998, Persma mengalami penurunan performa sehingga harus terdegradasi dari kompetisi liga tertinggi saat itu, Divisi Utama, di musim 2001 dan turun kasta ke Divisi Satu. Persma kembali ke Divisi Utama di musim 2007–2008 tetapi hanya bertahan satu musim di kompetisi kasta tertinggi Indonesia karena pembentukan Liga Super Indonesia, dan berbagai masalah klub sehingga Persma tidak mengikuti kompetisi liga dari tahun 2009 sampai 2011. Masalah Persma dengan pemain asing, di mana kontrak yang tidak dipenuhi pihak manajemen klub membuat Persma dilaporkan ke otoritas FIFA. Alhasil, Persma dicoret dari keanggotaan PSSI atas rekomendasi dari FIFA pada tahun 2011.^[7]

Era Persma 1960

Pada 4 Juni 2013, Persma resmi kembali menjadi anggota PSSI, dengan nama baru Persma 1960 atau Persma Manado 1960.^[8] Saat itu pengurus klub tidak lagi memakai APBD sebagai sumber dana, tetapi memakai dana swadaya, serta tidak menerima sponsor dari siapapun termasuk pemerintah dan tokoh-tokoh politik di daerah. Pengurus Persma 1960 berupaya agar klub tersebut jauh dari kepentingan dari partai politik manapun.^[9] Hanya saat mengikuti dan menjuarai Liga 3 2019 Sulawesi Utara, klub sempat menggunakan nama Persma 1960 Merdeka atas kerja sama dengan Komando Daerah Militer XIII/Merdeka saat kompetisi berlangsung.^[10]

Sebagai juara bertahan, Persma 1960 malah gagal mempertahankan trofi karena tidak mengikuti kompetisi Liga 3 2020 Sulawesi Utara yang disebabkan pandemi Covid-19, begitu pun dengan Liga 3 Liga 3 2021 Sulawesi Utara.