Nama Palembayan memiliki dua versi asal-usul. Versi pertama menyebutkan bahwa nama ini berasal dari kata Palambaian, merujuk pada air laut yang dahulu melambai-lambai di wilayah tersebut. Versi lain mengatakan nama ini berasal dari Palimbekan, karena daerah ini dikenal sebagai penghasil limbek, sejenis ikan rawa yang dikeringkan.[2]