Film tersebut berlatar belakang pada masa Reich Ketiga dan tentang cinta terlarang antara penyanyi Jerman Willie (Hanna Schygulla) dan komposer Yahudi Swiss Robert Mendelssohn (sebuah karakter yang berdasarkan pada Rolf Liebermann), yang aktif membantu kelompok bawah tanah Yahudi Jerman.
Dari 23 film layar lebar yang Fassbinder sutradarai, Lili Marleen merupakan satu-satunya film yang Jerman wakilkan untuk Academy untuk dijadikan nominasi Film Berbahasa Asing Terbaik (film tersebut, meskipun produksi Jerman, merupakan salah satu film dari beberapa film yang Fassbinder ambil gambarnya dalam bahasa Inggris). Meskipun demikian, film tersebut tidak masuk nominasi.[2]