Sesuai dengan aturan kualifikasi, play-off ini dilaksanakan hanya antara 6 tim runner-up, selain 2 tim runner-up terbaik untuk menentukan 3 tim dari Zona Eropa lainnya yang melaju ke putaran final dalam sistem kandang–tandang.
Dari hasil pembandingan tersebut, Swedia dan Polandia keluar sebagai dua tim terbaik dan melaju ke putaran final.
Penempatan pot
Ke-6 tim runner-up ditempatkan dalam 2 pot yang ditentukan berdasarkan peringkat mereka pada bulan September2005 dalam Peringkat Dunia FIFA. Pembagiannya adalah sebagai berikut.
Pot 1
Ceko, peringkat ke-4 dunia, peringkat ke-2 Eropa,[1]
Swiss, peringkat ke-38 dunia, peringkat ke-19 Eropa.[1]
Pengundian dilaksanakan pada 14 Oktober2005 di Kantor FIFA di Swiss. Pengundian pertama dilakukan untuk menentukan pemasangan antara tim dari Pot 1 dengan tim dari Pot 2. Selanjutnya, dilakukan pengundian pula untuk menenetukan tim mana yang menjadi tuan rumah pada leg pertama dan kedua, juga di tempat dan waktu yang sama.
Penentuan pemenang
Penentuan pemenang play-off diputuskan untuk menggunakan Metode Skor Aggregat Standar FIFA, dengan penggunaan aturan gol tandang, dan jika diperlukan maka perpanjangan waktu dan adu penalti akan dilaksanakan pada pertandingan leg kedua. Setiap pemenang play-off ini akan mendapatkan masing–masing 1 tempat di putaran final di Jerman.