Kepulauan Kerguelen (/ˈkɜːrɡəlɛn/ atau /ˈkɜːrɡələn/;[2] dalam bahasa PrancisÎles Kerguelencode: fr is deprecated tetapi secara resmi disebut Archipel des Kerguelencode: fr is deprecated , diucapkan[kɛʁɡeˈlɛn]), juga disebut Kepulauan Desolasi (Îles de la Désolationcode: fr is deprecated dalam bahasa Prancis), adalah gugusan pulau yang terletak di Samudra Hindia selatan dan merupakan salah satu bagian dari Dataran Kerguelen yang tidak tenggelam. Kepulauan ini merupakan salah satu tempat paling terpencil di Bumi. Kepulauan ini terletak sejauh 450km (280mi) dari Pulau Heard dan Kepulauan McDonald yang tidak berpenghuni dan lebih dari 3.300km (2.051mi) dari tempat terdekat yang berpenghuni. Kepulauan ini merupakan bagian dari Daratan Selatan dan Antartika Prancis dan secara administratif merupakan distrik yang terpisah.
Pulau utama di kepulauan ini disebut Grande Terre (luas 6.675km2 (2.577sqmi)) yang dikelilingi oleh sekitar 300 pulau yang lebih kecil. Iklim di Kerguelen dingin dan hembusan anginnya kencang. Kerguelen tidak memiliki penduduk asli, tetapi terdapat 45 hingga 100 ilmuwan dan insinyur yang ditugaskan oleh Prancis.[3] Kepulauan ini tidak memiliki bandar udara, sehingga Kerguelen hanya terhubung oleh kapal.