Didirikan pada tahun 1740, dengan pendirian kota, sebagai gereja utama Aconcagua, terletak di depan Plaza de Armas. Pendeta pertamanya adalah Dokter Don José de Rojas y Ovalle. Pada tahun 1845, Don José de los Dolores Villarroel melakukan rekonstruksi gereja paroki, hanya mengandalkan dukungan umat paroki, dan pekerjaan tersebut selesai pada tahun 1850.
Gereja Santo Filipus dijadikan takhta uskup dengan didirikannya Keuskupan San Felipe pada tahun 1925.
