Pada tahun 1911, Charles C. Stiles dan Brayton H. Ransom di Bureau of Animal Industry di Washington, D.C., mencetuskan perlunya sebuah jurnal parasitologi di Amerika. Mereka meminta Henry Baldwin Ward, yang saat itu menjabat sebagai profesor zoologi di Universitas Illinois, untuk memulai produksinya.[2] Nama jurnal tersebut awalnya diusulkan sebagai The American Journal of Parasitology, tetapi George H. Simmons, sekretaris dan editor untuk Journal of the American Medical Association, mengubahnya menjadi Journal of Parasitology karena ia merasa nama tersebut akan lebih mendapat pengakuan internasional.[3] Ward, sebagai pemilik dan editor pengelola, merilis edisi pertama jurnal tersebut pada bulan September 1914.[2] Jurnal ini dimulai sebagai jurnal triwulanan untuk "zoologi medis... [khususnya untuk] makalah singkat dan catatan penelitian tentang parasit hewan."[4]
Pada tahun 1924, Ward dan William Walter Cort mendirikan American Society of Parasitologists, dengan Ward menjadi presiden pertamanya.[1] Sejak tahun 1925, risalah perhimpunan tersebut diterbitkan di dalam jurnal. Setelah beberapa putaran diskusi, perhimpunan memutuskan pada bulan Desember 1931 untuk mengadopsi jurnal tersebut sebagai publikasi resminya. Sejak September 1932, jurnal ini resmi menjadi publikasi perhimpunan tersebut.[2] Ward mengundurkan diri sebagai pemilik dan editor, meskipun ia terus bertugas di dewan editorial selama setahun berikutnya. Cort menjadi Ketua Komite Editorial yang beranggotakan Robert Hegner dan Francis Root.[3] Perhimpunan memutuskan untuk mencantumkan tulisan "Founded by Henry Baldwin Ward" (Didirikan oleh Henry Baldwin Ward) secara permanen pada sampul jurnal.[4]