Penangkapan Gaara
Setelah 3 tahun berlalu, Gaara menjadi Kazegake ke-5 menggantikan ayahnya yang meninggal dibunuh Orochimaru.
Di part 2 Naruto Shippuden, pergerakan Akatsuki mulai kelihatan, Gaara di incar oleh Akatsuki karena ia adalah seorang Jinchuuriki ekor satu (Ichibi) Shukaku. Desa Suna di serang oleh dua anggota Akatsuki Sasori dan Deidara. Saat Deidara melakukan penyerangan dari langit dengan burung tanah liat miliknya, untuk mencari keberadaan Gaara, akhirnya Gaara pun muncul. Pertarungan sengit pun terjadi di atas langit. Walaupun Gaara berhasil memutuskan salah satu tangan Deidara, akhirnya Gaara berhasil di kalahkan oleh Deidara dan sekarat oleh peledak tanah liat C3 milik Deidara, Gaara pun di bawa oleh Deidara ke tempat Sasori menunggu.
Saat Kankurou menyusul mereka, tetapi dicegat oleh Sasori dan dikalahkan oleh racun boneka miliknya. Akhirnya mereka pun mereka sampai di markas Akatsuki, Bijuu yang ada pada tubuh Gaara pun di segel di patung Gedo Mazou milik Akatsuki. Saat rombongan Naruto datang dan meminta untuk mengembalikan Gaara, tetapi Gaara sudah tidak bernyawa karena Bijuu dalam dirinya sudah dikeluarkan.
Setelah Sakura dan Nenek Chiyo mengalahkan Sasori cucu Nenek Chiyo sendiri, akhirnya mereka menyusul Naruto dan Kakashi untuk menyelamatkan Gaara dari tangan Deidara. Dan akhirnya Tim Guy pun datang untuk membantu Tim Kakashi mengalahkan Deidara, tetapi Deidara mencoba meledakkan dirinya sendiri, tak di sangka itu adalah sebuah trik untuk membuat Deidara kabur dari dalam tanah.
Saat mereka sudah sampai di Desa Suna, tetapi Gaara sudah mati dan membuat Naruto sedih, lalu Naruto menyalahkan Nenek Chiyo yang telah menyegel Shukaku dalam tubuh Gaara. Saat suasana mulai tenang, akhirnya Nenek Chiyo menggunakan jurus perpindahan nyawa (jutsu tensei) dengan bantuan chakra Naruto, Gaara pun hidup kembali, tetapi sebagai gantinya pun Nenek Chiyo mati.
Pertemuan 5 Kage
Disini, Gaara perwakilan Kazekage dari Desa Suna pergi ke negara Besi bersama Temari dan Kankurou untuk diadakan pertemuan rapat 5 Kage. Saat rapat di mulai ia pun diolok2 oleh Tsuchikage (Oonoki) karena ia belum pantas mendapatkan gelar Kage, karena ia masih terlalu muda untuk mendapatkan gelar tersebut.
Walaupun begitu ia menyatakan memiliki pemikiran yang luas untuk memberikan pendapat dalam rapat 5 Kage ini.
Saat Sasuke menyerang pertemuan 5 Kage, ia menyelamatkan Sasuke dari serangan Raikage (A) dan membujuknya untuk kembali ke jalan yang benar, tetapi Sasuke menolak, karena ia telah menutup mata dan tujuannya hanya ada pada kegelapan.
Setelah rapat selesai, ia pergi ke Negara Besi untuk bertemu Naruto dan memberitahukan apa yang terjadi di pertemuan 5 Kage. Setelah pembicaraan pun selesai, ia meminta kepada Naruto untuk melakukan yang terbaik sebagai teman Sasuke, karena baginya dulu teman hanya sebuah kata untukku, tetapi tidak sekarang setelah aku bertemu denganmu.