Dari posisi ini, ia mengarahkan proses yang memindahkan sekolah-sekolah berbahasa Basque (ikastolak) ke dalam jaringan pendidikan publik Basque atau sektor pendidikan swasta berlisensi Basque.[5]
Monumen untuk Fernando Buesa di lokasi pembunuhannya.
Pada 22 Februari 2000, Buesa dibunuh oleh kelompok separatis ETA saat ia sedang berjalan di kampus universitas di Vitoria-Gasteiz. Serangan bom mobil tersebut juga menewaskan pengawalnya, Jorge Díez Elorza, anggota polisi Basque (ertzaintza).[7]
Pada saat kematiannya, Buesa menjabat sebagai pemimpin PSE-EE di Álava dan juru bicara PSE-EE di Parlemen Basque.
Arena kandang tim basket Vitoria-Gasteiz Baskonia, yang sebelumnya dikenal sebagai Araba Arena, diganti namanya menjadi Fernando Buesa Arena setelah kematiannya.[9]
↑"por el que se concede, a título póstumo, la Gran Cruz de la Orden Civil de Alfonso X el Sabio a don Fernando Buesa Blanco". Real DecretoNo. 226/2005per (dalam bahasa Spanyol). Vol.49. hlm.7155. Diakses tanggal 27 July 2022– via BOE.