Pada akhir 1990-an, Springer dan EDP Sciences memutuskan untuk menggabungkan Zeitschrift für Physik dan Journal de Physique. Dengan tambahan Il Nuovo Cimento dari Società Italiana di Fisica, European Physical Journal mulai diterbitkan pada Januari 1998. Saat ini, EPJ merupakan hasil penggabungan dan kelanjutan dari Acta Physica Hungarica, Anales de Física, Czechoslovak Journal of Physics, Il Nuovo Cimento, Journal de Physique, Portugaliae Physica, dan Zeitschrift für Physik.
Keluarga jurnal akses terbuka berumur pendek PhysMath Central[1] digabungkan pada tahun 2011 ke dalam European Physical Journal,[2] yang telah menawarkan opsi akses terbuka sejak tahun 2006.[3]
Pada tahun 2023, editor menarik kembali (retraksi) sebuah artikel jurnal yang diterbitkan pada tahun 2022 di European Physical Journal Plus yang mengeklaim tidak menemukan bukti adanya perubahan iklim.[5][6]
Artikel tersebut dibagikan secara luas; metrik artikel menunjukkan bahwa artikel tersebut berada di persentil ke-99 (peringkat ke-293) dari 512.033 artikel yang dipantau dengan usia serupa di seluruh jurnal, dan berada di persentil ke-99 (peringkat ke-1) dari 41 artikel yang dipantau dengan usia serupa di European Physical Journal Plus.[7] Artikel tersebut dikutip oleh para penyangkal perubahan iklim dan dalam dua segmen di Sky News Australia (yang dikenal karena misinformasi ilmu iklim).[6]
Catatan retraksi tersebut tidak menyoroti kesalahan, pemalsuan data atau gambar, plagiarisme, atau alasan lain yang biasanya mendasari retraksi: untuk rekonstruksi mengenai apa yang terjadi, lihat[8] dan[9] di mana catatan dari para peninjau (reviewer) juga dapat ditemukan.
