Setelah pensiun sebagai pemain kemudian memulai karier kepelatihannya sebagai pelatih tim senior pada klub Marseille dan Aris Thessaloniki[3] kemudian menjadi asisten manajer di beberapa klub sebelum menangani Saint-Étienne sejak tahun 2009.[4]
Pada Juli 2022, Galtier ditunjuk sebagai kepala pelatih tim utama Paris Saint-Germain dengan menandatangani kontrak berdurasi hingga musim panas 2024.[5]