Hingga tahun 2011, ulasan lengkap diterbitkan dalam Brain Research Reviews, yang kini telah diintegrasikan ke dalam bagian utama, meskipun dengan penomoran volume yang independen. Pada tahun 2006, empat bagian jurnal semi-independen lainnya yang telah berdiri sebelumnya (Cognitive Brain Research, Developmental Brain Research, Molecular Brain Research, dan Brain Research Protocols) digabungkan ke dalam Brain Research.
Jurnal ini memiliki sembilan subbagian utama:
Sistem Seluler dan Molekuler
Perkembangan, Regenerasi, dan Penuaan Sistem Saraf
Neurofisiologi, Neurofarmakologi, dan bentuk Komunikasi Interseluler lainnya