Alicia Yinema Kate Nungarai Oshlack[3][2] adalah seorang ahli bioinformatika asal Australia yang menjabat sebagai Co-Head of Computational Biology di Peter MacCallum Cancer Centre, Melbourne, Victoria. Oshlack dikenal karena kontribusinya dalam pengembangan metode analisis data transkriptom[4] untuk mengukur ekspresi gen. Dia juga telah mengkaji peran ekspresi gen dalam evolusi manusia dengan membandingkan manusia, simpanse, orangutan, dan kera rhesus. Selain itu, ia berkolaborasi dalam analisis data untuk memajukan penggunaan RNA-sequencing (RNA-seq) dalam diagnosis penyakit melalui sampel RNA klinis.
Riset
Analisis ekspresi gen
Penelitian Oshlack [5] berfokus pada pengembangan teknik analisis ekspresi genom, dengan penekanan pada pendekatan komputasi dan statistik untuk data transkriptom. Karya-karyanya mencakup metode untuk koreksi latar belakang mikroarray dua warna,[6] normalisasi data mikroarray,[7] analisis perbandingan data RNA-seq,[8][9] serta normalisasi pola metilasi dalam data beadchip DNA manusia.[10]
Evolusi manusia
Metodologi yang dikembangkan oleh Oshlack telah memungkinkan analisis tingkat ekspresi gen antara manusia dan primata lainnya secara objektif. Penelitiannya yang membandingkan tingkat ekspresi gen pada jaringan hati lima individu dari empat spesies primata—manusia, simpanse, orangutan, dan kera rhesus—mengungkapkan adanya evolusi cepat pada faktor transkripsi pada manusia.[11] Penelitian terkait lainnya mempelajari perubahan tingkat ekspresi faktor-faktor ini di berbagai jaringan manusia.[12] Sebagai penghargaan atas karyanya, Alicia Oshlack menerima Medali Ruth Gani untuk Genetika Manusia dari Akademi Ilmu Pengetahuan Australia pada tahun 2011.
↑Ritchie, M. E.; Silver, J; Oshlack, A; Holmes, M; Diyagama, D; Holloway, A; Smyth, G. K. (2007). "A comparison of background correction methods for two-colour microarrays". Bioinformatics. 23 (20): 2700–7. doi:10.1093/bioinformatics/btm412. PMID17720982.
