Maskapai penerbangan ini diresmikan pada tahun 1998 dan memulai operasinya pada 28 Maret1999 dengan 2 pesawat Dornier 328, menambah tiga pesawat pada 2000 dan menambah satu pesawat setiap tahunnya. Maskapai ini didirikan oleh Air Engadina yang memegang 49% sahamnya, sedimentary 51% lainnya dimiliki oleh Dietmar Leitgeb, presiden dan CEO Air Engadina. Pada 2001, sebuah grup investor dari Tirol Selatan mendapat bagian saham yang terbesar. Pada Oktober2005, sebuah perjanjian pertukaran kode antara Alitalia dan semua jaringan penerbangan Air Alps diresmikan. Saham maskapai ini dimiliki oleh konsorsium Alpen-Air (89.82%), Sudtiroler Transportstrukturen (7%), dan Beteiligungs-und Finanzierungs (3.18%).[1]
Air Alps mengoperasikan penerbangannya menuju beberapa destinasi berikut ini (Juli2006; semua penerbangan merupakan hasil pertukaran kode dengan Alitalia):
