Sebagian besar dari wilayah Afrotropika, kecuali ujung selatan Afrika, memiliki iklim tropis. Sebuah sabuk gurun-gurun lebar, termasuk gurun Gurun Sahara dan Atlantik di Afrika Utara dan Gurun Arab di Semenanjung Arab memisahkan Afrotropika dan wilayah Palearktika, yang mencakup Afrika Utara dan Eurasia iklim sedang.