Pendidikan S1-nya di Universitas Gadjah Mada dengan mengambil program studi ilmu filsafat dan lulus tahun 1983. Kemudian melanjutkan S2 di Universitas Indonesia pada program Ilmu Lingkungan dan berhasil lulus pada 1992. Program doktornya (S3) ia selesaikan di Universitas Airlangga pada program ilmu sosial pada 2003.
Karier
Warsono pernah menjabat Ketua Jurusan Pendidikan Moral Pancasila dan Kewarganegaraan (PMPKn) pada 2002–2006. Setelah itu, dia terpilih menjadi Dekan Fakultas Ilmu Sosial periode 2006–2010. Selanjutnya sejak 2010-2014 ia menjabat wakil rektor III Universitas Negeri Surabaya (Unesa).[4]
Rektor Unesa
Sosok pengagum Bung Karno dan Gus Dur ini terpilih menjadi rektor Universitas Negeri Surabaya dalam sidang senat Unesa. Ia berhasil meraih 62 suara. Adapun rivalnya Prof. Nurhasan (Pembantu Rektor IV) meraih 35 suara, dua suara memilih Prof. Yatim Riyanto (dosenFakultas Ilmu Pendidikan), dan satu suara abstain. Warsono yang saat itu menjabat Pembantu Rektor III tidak menduga ia akan berhasil memenangkan pemilihan rektor.[2]