Tokkeitai yang asli dikenal sebagai Seksi Urusan Umum dan menangani urusan kepolisian militer dan personel di dalam Angkatan Laut: personel, disiplin, dan pencatatan. Tokkeitai mengambil peran yang lebih aktif, sebagian untuk mencegah Kempeitai dan Angkatan Darat ikut campur dalam urusan Angkatan Laut.
Unit ini sangat aktif di wilayah Pasifik Selatan dan Area Kontrol Angkatan Laut, dan sama berpengaruhnya dengan Kempeitai. Unit ini memiliki peran komisaris yang sama dalam hubungannya dengan musuh eksternal atau orang-orang yang mencurigakan, dan mengawasi unit-unit internal untuk kemungkinan pembelot atau pengkhianat di bawah doktrin keamanan Kikosaku.
Tergabung dalam unit angkatan laut, mereka bertugas sebagai polisi kolonial di beberapa wilayah Pasifik yang diduduki. Kemudian, tuduhan kejahatan perang dilayangkan terhadap mereka dalam peran tersebut karena tindakan seperti pemaksaan perempuan penghibur dari Indonesia, Indochina, dan Cina untuk menjadi budak seks.[2]
Selain tanggung jawabnya sebagai polisi militer, unit ini merupakan cabang operatif dari Dinas Rahasia Angkatan Laut Kekaisaran Jepang (Kantor Informasi (情報局code: ja is deprecated , Jōhō-kyoku)), yang bertanggung jawab atas kontra intelijen, perlindungan eksekutif, perlindungan pasukan, pemulihan dan analisis informasi untuk pelaksanaan operasi penyamaran, dan mendukung operasi tempur darat (jika perlu). Anggotanya juga menyediakan keamanan lokal di dekat pangkalan angkatan laut. Pada minggu-minggu terakhir Perang Pasifik, unit ini termasuk di antara unit keamanan yang disiapkan untuk pertempuran melawan Jepang Daratan yang direncanakan akan diinvasi oleh Sekutu dalam Operasi Downfall.